Ученые Университета шт.Мичиган (США) по данным анализа РНК проростков кукурузы 2-недельного возраста научились прогнозировать урожайность.
При этом удалось достичь точности, сопоставимой с точностью прогнозирования потенциала урожайности по данным анализа ДНК, то есть на базе генетического анализа, пишет agroday.com.ua.
«Прогноз потенциала урожайности селекционных линий на базе анализа ДНК или РНК экономит месяцы и годы, которых требовали традиционные технологии селекции, когда можно было измерить урожайность лишь зрелых растений и только тогда увидеть генетический потенциал той или иной линии», — говорит профессор ботаники и сравнительной математики Университета шт. Мичиган Шинхан Шиу.
Исследователь уже давно использует сравнительные методы для решения проблем эволюционной и молекулярной биологии. Общепризнанно, что одной из главных проблем в биологии является взаимосвязь между информацией в ДНК, то есть, генотипом, и фенотипом. Выяснение этого вопроса является фундаментальным для понимания того, как проявляется генетическая информация в характеристиках растения. Поскольку РНК — это продукт ДНК, то выяснение строения РНК может повысить точность прогнозирования того, как генотип проявится в фенотипе. Для повышения точности ученые применили механизмы машинного обучения.
«Это может помочь новым программам селекции и может привести к совершенствованию генетических методов исследования. Мы обнаружили, что анализ РНК предоставляет дополнительную информацию, которую невозможно получить с помощью анализа лишь ДНК», — отметил Шинхан Шиу. Используя данный метод, исследователи смогли делать точные прогнозы цветения и урожайности еще до того, как растение сформировала соответствующие органы (цветки и семена).
Традиционные методы, которые базируются на моделях, которые используют генетические маркеры, идентифицировали только 1 из 14 генов, которые имеют большое влияние на сроки цветения. Зато модель, созданная Шинханом Шиу и его коллегами, позволило идентифицировать 5 таких генов.
Впрочем, пока авторы нового метода не спешат заявлять, что он заменит старый. Поэтому дальнейшие исследования будут направлены на совершенствование точности и эффективности нового метода.
Источник: www.agroreview.com
